opecv cuda加速官方教程2:Using a cv::cuda::GpuMat with thrust
原文地址Global推力( thrust)是一个非常强大的库各种cuda加速算法。然而,推力设计用于矢量而不是倾斜矩阵。下面的教程将讨论如何将cv::cuda::GpuMat包装到可用于推力算法的推力迭代器中。本教程将向您展示如何:将GpuMat包装到一个推力迭代器中用随机数填充GpuMat对GpuMat的列进行排序将大于0的值复制到新的gpu矩阵使用带推力的流Wrapping a GpuMat
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推力( thrust)是一个非常强大的库各种cuda加速算法。然而,推力设计用于矢量而不是倾斜矩阵。下面的教程将讨论如何将cv::cuda::GpuMat包装到可用于推力算法的推力迭代器中。
本教程将向您展示如何:
-
将GpuMat包装到一个推力迭代器中
-
用随机数填充GpuMat
-
对GpuMat的列进行排序
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将大于0的值复制到新的gpu矩阵
-
使用带推力的流
Wrapping a GpuMat into a thrust iterator
下面的代码将为GpuMat生成一个迭代器
/*
@Brief GpuMatBeginItr returns a thrust compatible iterator to the beginning of a GPU mat's memory.
@Param mat is the input matrix
@Param channel is the channel of the matrix that the iterator is accessing. If set to -1, the iterator will access every element in sequential order
*/
template<typename T>
thrust::permutation_iterator<thrust::device_ptr<T>, thrust::transform_iterator<step_functor<T>, thrust::counting_iterator<int>>> GpuMatBeginItr(cv::cuda::GpuMat mat, int channel = 0)
{
if (channel == -1)
{
mat = mat.reshape(1);
channel = 0;
}
CV_Assert(mat.depth() == cv::DataType<T>::depth);
CV_Assert(channel < mat.channels());
return thrust::make_permutation_iterator(thrust::device_pointer_cast(mat.ptr<T>(0) + channel),
thrust::make_transform_iterator(thrust::make_counting_iterator(0), step_functor<T>(mat.cols, mat.step / sizeof(T), mat.channels())));
}
/*
@Brief GpuMatEndItr returns a thrust compatible iterator to the end of a GPU mat's memory.
@Param mat is the input matrix
@Param channel is the channel of the matrix that the iterator is accessing. If set to -1, the iterator will access every element in sequential order
*/
template<typename T>
thrust::permutation_iterator<thrust::device_ptr<T>, thrust::transform_iterator<step_functor<T>, thrust::counting_iterator<int>>> GpuMatEndItr(cv::cuda::GpuMat mat, int channel = 0)
{
if (channel == -1)
{
mat = mat.reshape(1);
channel = 0;
}
CV_Assert(mat.depth() == cv::DataType<T>::depth);
CV_Assert(channel < mat.channels());
return thrust::make_permutation_iterator(thrust::device_pointer_cast(mat.ptr<T>(0) + channel),
thrust::make_transform_iterator(thrust::make_counting_iterator(mat.rows*mat.cols), step_functor<T>(mat.cols, mat.step / sizeof(T), mat.channels())));
}
我们的目标是拥有一个从矩阵开始的迭代器,并正确地递增以访问连续的矩阵元素。这对于一个连续的行来说是微不足道的,但是对于一个倾斜矩阵的列呢?为此,我们需要迭代器知道矩阵的维数和步长。这个信息被嵌入到step_functor中。
template<typename T> struct step_functor : public thrust::unary_function<int, int>
{
int columns;
int step;
int channels;
__host__ __device__ step_functor(int columns_, int step_, int channels_ = 1) : columns(columns_), step(step_), channels(channels_) { };
__host__ step_functor(cv::cuda::GpuMat& mat)
{
CV_Assert(mat.depth() == cv::DataType<T>::depth);
columns = mat.cols;
step = mat.step / sizeof(T);
channels = mat.channels();
}
__host__ __device__
int operator()(int x) const
{
int row = x / columns;
int idx = (row * step) + (x % columns)*channels;
return idx;
}
};
step functor 接受一个索引值并返回从矩阵开始的适当偏移量。计数迭代器只是在像素元素的范围内递增。结合到transform_迭代器中,我们有一个迭代器,它从0到M*N计数,并正确地递增以说明GpuMat的倾斜内存。不幸的是,这不包括任何内存位置信息,为此我们需要一个 thrust::device_ptr。通过将设备指针与转换迭代器相结合,我们可以将推力指向矩阵的第一个元素,并相应地进行步进。
Fill a GpuMat with random numbers
现在我们有了一些很好的函数来生成用于推力的迭代器,让我们用它们来做一些OpenCV做不到的事情。不幸的是,在撰写本文时,OpenCV没有任何Gpu随机数生成。谢天谢地,struch确实做到了,现在两者之间的互操作变得微不足道了。示例取自http://stackoverflow.com/questions/12614164/generating-a-random-number-vector-between-0-and-1-0-using-thrust
首先,我们需要编写一个函子来生成我们的随机值。
struct prg
{
float a, b;
__host__ __device__
prg(float _a = 0.f, float _b = 1.f) : a(_a), b(_b) {};
__host__ __device__
float operator()(const unsigned int n) const
{
thrust::default_random_engine rng;
thrust::uniform_real_distribution<float> dist(a, b);
rng.discard(n);
return dist(rng);
}
};
这将接受一个整数值,并输出一个介于a和b之间的值。现在我们将通过推力变换用0到10之间的值填充我们的矩阵.
{
cv::cuda::GpuMat d_value(1, 100, CV_32F);
auto valueBegin = GpuMatBeginItr<float>(d_value);
auto valueEnd = GpuMatEndItr<float>(d_value);
thrust::transform(thrust::make_counting_iterator(0), thrust::make_counting_iterator(d_value.cols), valueBegin, prg(-1, 1));
cv::Mat h_value(d_value);
}
Sort a column of a GpuMat in place
让我们用随机值和索引填充矩阵元素。之后我们将对随机数和索引进行排序。
{
cv::cuda::GpuMat d_data(1, 100, CV_32SC2);
// Thrust compatible begin and end iterators to channel 1 of this matrix
auto keyBegin = GpuMatBeginItr<int>(d_data, 1);
auto keyEnd = GpuMatEndItr<int>(d_data, 1);
// Thrust compatible begin and end iterators to channel 0 of this matrix
auto idxBegin = GpuMatBeginItr<int>(d_data, 0);
auto idxEnd = GpuMatEndItr<int>(d_data, 0);
// Fill the index channel with a sequence of numbers from 0 to 100
thrust::sequence(idxBegin, idxEnd);
// Fill the key channel with random numbers between 0 and 10. A counting iterator is used here to give an integer value for each location as an input to prg::operator()
thrust::transform(thrust::make_counting_iterator(0), thrust::make_counting_iterator(d_data.cols), keyBegin, prg(0, 10));
// Sort the key channel and index channel such that the keys and indecies stay together
thrust::sort_by_key(keyBegin, keyEnd, idxBegin);
cv::Mat h_idx(d_data);
}
Copy values greater than 0 to a new gpu matrix while using streams
在这个例子中,我们将看到cv::cuda::Streams如何与推力一起使用。不幸的是,这个特定的示例使用的函数必须将结果返回给CPU,因此它不是流的最佳使用。
{
cv::cuda::GpuMat d_value(1, 100, CV_32F);
auto valueBegin = GpuMatBeginItr<float>(d_value);
auto valueEnd = GpuMatEndItr<float>(d_value);
cv::cuda::Stream stream;
//! [random_gen_stream]
// Same as the random generation code from before except now the transformation is being performed on a stream
thrust::transform(thrust::system::cuda::par.on(cv::cuda::StreamAccessor::getStream(stream)), thrust::make_counting_iterator(0), thrust::make_counting_iterator(d_value.cols), valueBegin, prg(-1, 1));
//! [random_gen_stream]
// Count the number of values we are going to copy
int count = thrust::count_if(thrust::system::cuda::par.on(cv::cuda::StreamAccessor::getStream(stream)), valueBegin, valueEnd, pred_greater<float>(0.0));
// Allocate a destination for copied values
cv::cuda::GpuMat d_valueGreater(1, count, CV_32F);
// Copy values that satisfy the predicate.
thrust::copy_if(thrust::system::cuda::par.on(cv::cuda::StreamAccessor::getStream(stream)), valueBegin, valueEnd, GpuMatBeginItr<float>(d_valueGreater), pred_greater<float>(0.0));
cv::Mat h_greater(d_valueGreater);
}
首先,我们将用流上-1和1之间随机生成的数据填充GPU mat。
// Same as the random generation code from before except now the transformation is being performed on a stream
thrust::transform(thrust::system::cuda::par.on(cv::cuda::StreamAccessor::getStream(stream)), thrust::make_counting_iterator(0), thrust::make_counting_iterator(d_value.cols), valueBegin, prg(-1, 1));
注意使用推力:: system :: cuda :: par.on(…),这会创建一个执行策略,用于在流上执行推力代码。 由于版本7.5,与CUDA Toolkit一起分发的推力版本中存在一个错误,这尚未修复。 此错误会导致代码无法在流上执行。 但是,可以通过使用从Git存储库的最新版本的推力来修复该错误。 (http://github.com/thrusththust.git)接下来我们将通过使用以下谓词使用 thrust::count_if来确定多于0的值大于0:
template<typename T> struct pred_greater
{
T value;
__host__ __device__ pred_greater(T value_) : value(value_){}
__host__ __device__ bool operator()(const T& val) const
{
return val > value;
}
};
我们将使用这些结果创建一个输出缓冲区来存储复制的值,然后使用具有相同谓词的copy_if来填充输出缓冲区。最后,我们将把这些值下载到CPU mat中以供查看。
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